被毁坏的博物馆外墙 © Fouad Elkoury

与此同时，藏品的收藏状况也极为严重：储藏室中积水严重，小型文物因无人护理且存放时间过长，遭到不同程度的销蚀，尤其是木制品和人像俑，已然变得面目全非；大型石器被遗留在应急箱中，没有任何通风，显露出盐分腐蚀的痕迹。相邻的古物总局侧面更是被炮弹炸毁，地图、照片和文档记录与45个装有考古用具的箱子均被付之一炬。

万幸的是，大部分文物依旧被相对完好地保存下来。在钢筋混凝土墙被凿开后，人们似乎能够听见那些被封存15年的文物的低声呜咽。

博物馆的整体修缮在战后重启，1999年，这栋三层楼的建筑的第一层和第二层重新开放，但地下室仍然处于关闭状态，2010年才终于对公众敞开大门。它举办的首次展览，是一次殡葬艺术的大型巡礼。从25万年前的人类牙齿开始，直到19世纪的奥斯曼石刻，与亡者相关的陶器、石器、象牙护身符、小塑像、珠宝和武器等均被展出。