北京故宫里出了坤宁宫有一个御花园。不过据马渭源考证，明初朱元璋时代似乎还没有御花园之说，“史书中记载只看到了花苑，朱元璋为了不劳民自己动手在里面种一些花草、蔬菜和谷物。”

明故宫“御花园”的位置，大概在今后宰门、玉带河一带。北京的故宫虽然在结构上基本跟南京明故宫一致，但在御花园的设计与位置上却有不同，北京故宫的御花园在宫城即紫禁城的正北面。

　朱棣之子明仁宗

一度打算还都南京

如今，南京明故宫宫殿已经荡然无存。它是怎么消失的呢？

马渭源说，它经受的第一次浩劫跟朱棣有关。朱棣登基后，即着手迁都老巢北平即后来改称的北京。一方面克隆南京明故宫建筑设计格局，在北京大搞基本建设；另一方面，对南京明故宫及其相关设施进行拆卸。

有幸的是，朱棣之子明仁宗朱高炽当政期间对皇宫有一定程度的修复，他还打算将都城迁回南京，但皇宫还没有完全修好，朱高炽就突然死了。新上台的 宣德帝拒绝还都南京。虽然南京还是陪都，但皇宫无人精心看管、打理，明朝中期前后发生了大火灾，明故宫的前朝三大殿等先后遭火而毁。

第二次浩劫是明末清初，清军南下，不仅占领了南京，还肆意蹂躏明故宫。清军在明故宫午门前，筑起八旗兵驻防城，把将军、都统二署设在明故宫。皇城、宫阙顿时成了“废都”“废宫”。

清朝末年太平天国运动爆发，太平军进攻南京，与驻扎在明故宫的驻防清军进行激烈的战斗，一代明宫成为双方交火的战场，明故宫又遭受了第三场浩劫。

如今，明故宫只剩下残石破瓦。