1959年中国历史博物馆和中国革命博物馆外景

时间跨入21世纪。2003年2月，在中国历史博物馆和中国革命博物馆两馆基础上正式组建中国国家博物馆。国家博物馆应是以两馆为基础重新构建的代表国家最高水准的具有中华文明传统和时代特色的综合性博物馆。其展示内容应以中华五千年文明史为主线，包含中国古代历史、近现代历史、民族、民俗、艺术、美术、国际友谊等多方面内容。同时，国家博物馆并可成为接待国宾、举行重大国事活动的具有浓郁中华文明氛围的特殊场所。国家博物馆立足于中国历史博物馆和中国革命博物馆的历史和现有工作基础，立足于两馆文物构成，加强资源重组，努力构建一个与历史和发展、与人们精神文化需求相称的综合性国家博物馆。

在组织重组的同时，改扩建工程建设也拉开帷幕。2006年10月，国务院批准国家博物馆改扩建工程可行性研究报告，同意将“留三面”（保持西、南、北三面面貌不变，向东扩展）方案作为国家博物馆工程项目的建筑设计方案。