当然，由于“军火”和“纳粹艺术”等关键词，也为他带来了不少的麻烦。即使在他离世多年以后。

2015年，历史学家兼记者Thomas Buomberger和美术史学家Guido Magnaguagno共同出书，矛头指向军火商布尔勒的艺术收藏。书名《布尔勒的黑册子》(Le livre noir Bührle)就带着明显的火药味。书中内容不仅涉及对埃米尔·布尔勒购买艺术品的介绍，还包括布尔勒其人的详尽生平。而书中更直接指明布尔勒的某些藏品是非法掠夺而来。

当该书出版以后，布尔勒基金会发布声明痛斥，并指出“书中所指的19幅非法作品中的15幅都有确凿可查的出处。尽管该书作者坚决不愿认可，但事实是：70年前的作品易手记录出现漏洞，这并不自动说明这些画儿就是非法掠夺而来的。而在过去的两年里，两位作者没有来布尔勒基金或我们美术馆档案部咨询过一次。”