程甲本最大的历史贡献，是续补了后40回内容。依据脂批的记载，曹雪芹的确创作了小说的后半部，可惜已经“迷失”。程甲本补全内容，为后人提供了一个较可阅读的全作。在程伟元的序言中他自叙：“爰为竭力搜罗，自藏书家甚至故纸堆中无不留心，数年以来，仅积有廿余卷。一日偶于鼓担上得十余卷，遂重价购之，欣然翻阅，见其前后起伏，尚属接笋，然漶漫不可收拾。乃同友人细加厘剔，截长补短，抄成全部，复为镌板，以公同好，《红楼梦》全书始至是告成矣。”

随着《红楼梦》的传播，晚清时期《红楼梦》版本多达170余种。这些版本大多根据程甲本翻印，表明程甲本不仅是此前众多抄本的集大成者，也是后世《红楼梦》刊行本的最佳底本。

程甲本问世之后，根据其改写、续写、重写、仿写的小说作品不断涌现。比如逍遥子续作《后红楼梦》（30回）、临鹤山人《红楼圆梦》（31回）、海圃主人《续红楼梦》（40回）、陈少海《红楼复梦》（100回）、花月痴人《红楼幻梦》（14回）等。这些作者创作的动机不尽相同，有些是因为程甲本结局过悲，希望以大团圆收尾；有些是因为喜欢原著，信手仿写，游戏文字；有的则是认为后40回续作不佳，自己动手创作，结果成了狗尾续貂。

民国时期，开始出现新式标点和铅印本《红楼梦》。1949年以后，又出现了简体字版的《红楼梦》，这些版本绝大部分仍然依据程甲本印行。此外，众多的译本，包括英、法、德、俄、日多种外文以及满、蒙、藏、维吾尔族文字译本，均选用程甲本为底本。

程甲本的传播催生了红学的形成。早期研究《红楼梦》的代表人物，不论是脂砚斋、畸笏叟，还是杜斋、梅溪，他们大都是针对抄本，点评前80回的内容，产生的影响有限。在程甲本大量印行后，大量的学者投入《红楼梦》的研究中，在清代形成了王希廉《新评绣像红楼梦全传》、张新之评本《绣像石头记》和姚燮《增评补图石头记》三大重要评点本。还出现了针对《红楼梦》续书的点评，比如裕瑞所作的《枣窗闲笔》。民国时期，形成了《红楼梦》研究“索隐派”，这些学者认为《红楼梦》是清代历史的重现，小说中的人物和事件在现实中都有迹可循。代表著作是蔡元培的《石头记索隐》。这一流派之后，《红楼梦》研究进入新阶段，出现了“新红学派”，代表学者有胡适、俞平伯、周汝昌等，他们对曹雪芹生平和《红楼梦》进行了详实的考证，将研究拓宽到文本之外的诸多领域。