台北故宫博物院

作为民进党“故宫去中国化”措施的重要一环，故宫南院以“亚洲”作为主题，馆址定在民进党的南部重要票仓嘉义县太保市。故宫南院本应在陈水扁结束任期的2008年之前成立，但拖延了8年，终于在马英九结束2016年任期之前完成。当政权从民进党转移到国民党时，南院问题曾一度陷入僵局，关于南院名称是否要加上“故宫”、台北故宫是否要提供文物等问题均争论不休。

2007年1月，台北故宫将“故宫博物院组织条例”修正案递交立法机构，但并未马上通过，而是历经了一年多的讨论审议。其中最大的焦点是第一条，其原文是：“为整理、保管、展出原国立北平故宫博物院及国立中央博物院筹备处所藏之历代古文物及艺术品，并加强对中国古代文物艺术品之征集、研究、阐扬，以扩大社教功能，特设‘国立’故宫博物院，隶属于‘行政院’。”然而修正草案的版本剔除了台北故宫与“原国立北平故宫博物院”“原国立中央博物院”的关系，也提出了将“中国古代文物艺术品之征集、研究、阐扬”改为“国内外文物及艺术品之征集、研究、阐扬”。

民进党发起修正“组织条例”，引起了中国大陆官方媒体《人民日报》和新华社的强烈反应，也遭到台湾内部蓝营媒体和文化界的严厉批评。《联合报》称：“故宫试图抹杀文物历史，不仅不可能做到，也不是一项聪明的尝试。故宫的‘组织条例’也许有必要修正，但是不应借此扭曲历史，以达‘去中国化’的目的。”国民党民意代表的态度也非常强硬，在国民党选举占优势的情况下，民进党不得做出较大让步，在民进党最终的修正案中，原本希望去除“国立北平故宫博物院”和“国立中央博物院”的关联没有成功，“中国古代文物”的字样也没有发生改变。